二者性质有本质性的区别。经适房是政府解决住房困难家庭而建设的保障房；而回迁房是拆迁房屋补偿给拆迁户的房屋。拆迁补偿还要看是原址回迁还是异地安置。假如拆迁土地是建设经适房，那么回迁的就是经适房。假如是建设商品房，那么回迁补偿的就是商品房。就房屋质量来说，应该说二者区别不大。

题主好小产权房依照相关政策和法规解释是指集体土地用于商品房建设的，实际是违法建筑，小产权房由于没有土地产权，拆迁补偿标准低。而农村集体建设住房土地在划拨为城市建设用地时拆迁补偿，按拆迁补偿标准（包括土地）补偿给集体在分配到个人，相对较高

回迁房与商品房的区别：
1、区别
一：房价不同：在房价款方面，商品房与拆迁房有区别，商品房可立即上市，且在银行做抵押进行贷款。而回迁房享受国家政策的优惠，不含土地转让金，价格相对低廉且有小产权之说，故不享有商品房的上述权能。拆迁人以回迁房补偿被拆迁人的，补偿房屋由市政府有关主管部门参照经济适用住房政策核定价格，并按照经济适用住房政策管理。
2、区别
二：买卖双方的关系不同：商品房和回迁房买卖双方的关系不同，商品房的购买基础是开发商和购房者签订的《商品房买卖合同》，房屋的价款在合同中进行约定。而拆迁安置房屋的购买基础是拆迁单位和被拆迁人签订的拆迁补偿协议，在协议中进行约定。
3、区别
三：房屋的性质不同：拆迁的是商品房，回迁房自然是应当商品房。拆迁的是集体土地上的私房，或者是经济适用房，回迁房的性质通常不是商品房。购买回拆房一定要查清性质。经济适用房不得买卖；集体土地上的私房拆迁的回迁房，回迁房的所占土地性质，通常是划拨所得，没有交土地出让金，正式办理过户手续时，需交土地出让金。