真玛瑙石透明度不如人工合成的好，稍有混沌，有的可看见自然水线或“云彩”，而人工合成的玛瑙石透明度好，象玻璃球一样透明。

1、用刀子检查玛瑙的硬度，真玛瑙通常较硬，用刀子在其表面划一下，不会留下划痕，而玻璃制品则能留下痕迹。
2、查看玛瑙的做工的复杂度，由于玛瑙石质坚硬、润滑，不宜雕刻，但假如是真品玛瑙，雕刻的图案复杂精美，则价值较高。
3、看是否有条纹，真的玛瑙通常都有条纹,而且比较自然，假的条纹则比较均匀。
4、看是否有气泡，用放大镜仔细观察，假如含有气泡则说明是假的。
5、查看玛瑙的透明度，真玛瑙有半透明或不透明的，透明度有些混沌，有的可见自然水线，但人工合成的玛瑙透明度通常较好，并且无层次感。
6、感觉玛瑙的重量，玛瑙通常较重，可用两手掂量下大小相同的玛瑙，重的可能是真的。通常塑料的人工玛瑙手感较轻。
7、真玛瑙冬暖夏凉，用手去感觉一下玛瑙，真品会冬暖夏凉，而假的则随温度的变化而变化。
8、查看玛瑙的颜色，真玛瑙的颜色有层次感，色彩鲜亮，以红色最为珍贵，其次便是绿玛瑙、蓝玛瑙、紫玛瑙。假如选购红玛瑙，可仔细查看玛瑙的条带，真品会有密集排列的小红色斑点。

天然玛瑙石区别于假玛瑙石的最显著的标志，是其横断面有同心层纹结构，使用这个标志，整块玛瑙石较为容易识别，而经切割后的制成品，由于没有整齐明显的图案，则容易认错。但通常来说，天然玛瑙石手感凉，表面像涂了一层蜡，并有蜡的光泽，半透明，硬度在摩氏7级，用小刀刻不动，由于它是在熔融状态下形成的结晶体，多为球状，特别致密;表面研磨后更为细腻，在硬杂木板上急骤磨擦十几下，玛瑙石不热，木板却发烫;颜色常是几种混杂于一块之中，形成美丽的花纹、层纹、锦花等绚丽多彩的图案。